OutputDebugString関数でデバッガを起動しながらチェックを行います。
私が愛用しているのはデバッグもに太です。

基本的に
1) サービス登録
↓
2) 起動
↓
3) 変数チェック
↓
4) 停止
↓
5) ソース変更
↓
6) 起動　…

以下繰り返しです。

単体モジュールのテストを正確に行うのが完成の近道だと思います。
あと、私の場合サービスの機能のみを抽出して非サービスプログラムで組み、
十分にテストをしてからサービス機能をつけました。

あまり参考にならないかも知れませんが、私はこんな感じでやりました。

弟子さん，はじめまして。

デバッグの仕方について教えていただき，誠にありがとうございます。
「デバッグもに太」ですね。今後使用させていただきたいと思います。

自分でもいろいろ調査を行ってみたところ，「コントロールパネル」
「サービス」で，対象となるサービスの「スタートアップ」から
「デスクトップとの会話をサービスに許可」にチェックすると
サービスから起動を行ってもデバッガが起動されるようになりました。

やはりＯＳについての知識も詳しくならないといけないようですね。

弟子さんももし機会があれば試してみてください。

それでは失礼します。

>デスクトップとの会話をサービスに許可」にチェック

それは知りませんでした。今後参考にさせて頂きます。

↓デバッグ用に作った関数です。

// MFCのTRACEマクロを再現
// 1024を越えないように…（苦
void Trace( const char *format, ... )
{
char s[ 1024 ] = {0};

va_list args;
va_start( args, format );
vsprintf( s, format, args );
OutputDebugString( s );
va_end( args );
}