以下、WINNT.Hからの抜粋ですが、
これを見て何か気が付かないですか？

#define FILE_ATTRIBUTE_READONLY 0x00000001
#define FILE_ATTRIBUTE_HIDDEN 0x00000002
#define FILE_ATTRIBUTE_SYSTEM 0x00000004
#define FILE_ATTRIBUTE_DIRECTORY 0x00000010
#define FILE_ATTRIBUTE_ARCHIVE 0x00000020
#define FILE_ATTRIBUTE_ENCRYPTED 0x00000040
#define FILE_ATTRIBUTE_NORMAL 0x00000080
#define FILE_ATTRIBUTE_TEMPORARY 0x00000100

これらは全てビット指定になっているのでシステム上重なって設定されては不味いような物以外
は
同じファイルが複数の属性を持つことが可能だと言うことです。
例えば、FILE_ATTRIBUTE_READONLYとFILE_ATTRIBUTE_HIDDENは同時に設定可能ですよね。
あと加え言うならば、テキストエディタで作成したファイルなどは特にファイル属性を変えない
限り
アーカイブが付いています。
これは属性としてついているだけなので変更可能です。
一度、ご自分のPCでエクスプローラーの表示項目に属性を加えて見てください。
ほとんどのファイルにアーカイブが付いているのがわかるはずです。
また、ファイル属性のアーカイブがどういう意味を持っているのか一度調べて見られることを
お勧めします。

ＰＡＴＩＯさんご回答ありがとうございます。
大分納得しました。
もう一つ質問なのですがこのGetFileAttributesでいうシステムファイル
（FILE_ATTRIBUTE_SYSTEM）とはなにを指すのでしょう？
CONFIG.SYSや\WINNT配下のファイルで試してみましたがビットのANDで1が
立つものが見つけられませんでした。
何度もすいませんが宜しくお願いします。

Ｃドライブ直下にある「ｂｏｏｔ．ｉｎｉ」や「＊．ＳＹＳ」
なんか探してみると良いのではないですか

通常属性変更していなければ
ｂｏｏｔ．ｉｎｉには　リードオンリー　隠し属性、システム属性が着いている筈です
ＤＯＳコマンドで解除するには

C:\>attrib -R -H -S BOOT.INI
になり

ＤＯＳコマンドで設定するには
C:\>attrib +R +H +S BOOT.INI
になります

woodさん遅くなりました。
ありがとうございます。
Win9X系やWinNT4.0（のファイルシステムがFAT16?)だとプロパティでシステムの
チェックボックスがあるのですね。(Win2000NTFS/FAT32はないですが)
とりあえず現状は拡張子の判断で十分なので解決とさせていただきます。
また宜しくお願いします。