ファイル全体を一気に取り込んでおくことができるなら、そのまま同名で上書きすればよし。
それが無理ならとりあえず異なる名前で書いてからファイル名をすりかえ。

top.docというファイル名から、top12.docという名前を
どうやって作ればよいかを聞かれているようにも解釈できるのですが。

_splitpath()という関数を使うと、パス名やら拡張子やらをバラバラに分解できます。
あとは文字列操作で12をくっつけてあげればよいような。

入力ファイルも出力ファイルも物理的に別々なファイルなら、
プログラムの冒頭で２つのファイルをオープンしておけばいいし・・・

そういうことじゃないのかな？

あ、そういうコトか。失礼。
ならば単に文字列操作だけの問題です。
ファイル名の中で最後に現れる'.'を探し、
その前に12を挿入すればいいのだから。

FILE *fp1 ;
FILE *fp2 ;
char buff[256] ; // サイズは適当です。扱う情報にあわせて変更が必要。
char fileName1[256] ;
char fileName2[256] ;
char *p ;

printf(暇つぶしに作ってみました。) ;
printf(サンプルです。コンパイルしてません。ご利用はご自身の責任下でお願いします。);

strcpy( fileName1, top.doc ) ;
strcpy( fileName2, fileName1 ) ;

p = strchr( fileName2, '.' ) ; // 拡張子 .doc 開始部分取得
*p = '\0' ; // top.doc を top にする
strcat( fileName2, 12 ) ; // top を top12 にする
p = strchr( fileName1, '.' ) ; // top.doc の拡張子部分をもってくる
strcat( fileName2, p ) ; // top12 を top12.doc にする

// top.doc オープン処理 /////////////////////////////////////////////////////
fp1 = fopen( fileName1, rt ) ; // top.doc をテキスト読み込み用にオープン
if( fp1 == NULL )
{
return ; // top.doc オープン失敗
}

// top12.doc オープン処理 ///////////////////////////////////////////////////
fp2 = fopen( fileName2, wt ) ; // top12.doc をテキスト書き込み用にオープン
if( fp2 == NULL )
{
return ; // top12.doc オープン失敗
}

// top.doc 参照＆ top12.doc 書き込み //////////////////////////////////////
while( !feof(fp1) )
{
// １行取得
if( fgets( buff, 255, fp1 ) == NULL )
{
printf( top.doc 参照失敗 ) ;
break ;
}

// なにか加工するならこの場所で。

if( fputs( buff, fp2 ) == EOF )
{
printf( top12.doc 書き込み失敗 ) ;
break ;
}
}

// top.doc と top12.doc のクローズ処理 ////////////////////////////////////
fclose( fp1 ) ; // top.doc のクローズ
fclose( fp2 ) ; // top12.doc のクローズ

printf(終了です。);

みなさん
ありがとうございます。

おかげさまで、ファイルは、.docの付くファイルは
全て、スキャンさん、中身も新たに変わったものも出来たのですが、
一つ問題が起きました。

それは、
元のファイルが、XXX.doc
新しいファイルが、XXX12.doc
だから、
一通り既存のXXX.doc系のファイルに対して、スキャンが終わると、
次に、新しく出来たXXX12.doc系のファイルに対してもスキャンに入り、
同じく加工に行き、永久ループに入ります。

既存のXXX.doc系のファイルに対してだけに
この操作を限定させるようなことは出来ないのでしょうか？

書き込みを始める前にファイルの検索だけ先にやっちまっておけばいいんじゃないですか?

> 既存のXXX.doc系のファイルに対してだけに
> この操作を限定させるようなことは出来ないのでしょうか？
XXXの部分に数字が入らないのなら文字コードで比較すればよいと思います。
その他ファイル名の桁数が決まっていれば比較は容易に出来ますね。
そういう制約をつけたくなければ、一度つけたXXX12.docのファイル名を保存しておいて
「XXX.doc → XXX12.doc」化する時に一度作成されたかどうかチェックするなどしては
どうでしょうか？

あ、επιστημηさんの方式がスマートでよいと思います(ToT)

さっそくありがとうございます。

ファイルの検索は、
FINDFIRSTFILE
と
FINDNEXTFILE
の間でfopen、fcloseがうまくかかるか、見ながら
カウントしておいて、
再度、そのカウント回数分、
FINDFIRSTFILE
と
FINDNEXTFILE
をかけて、加工に行く
ということでいいでしょうか？

FINDFIRSTFILE、FINDNEXTFILEで取得したファイル名を
配列などに退避しておけばよろしいかと。
ファイルの加工は、ファイル名さえわかっていれば問題ないはず。
検索ループは１回で十分ですよ。

#include <windows.h>
#include <string>
#include <vector>
#include <iostream>

int main() {

std::vector<std::string> filenames;

// *.doc を(filenamesに)列挙する
WIN32_FIND_DATA find_data;
HANDLE handle = FindFirstFile(*.doc, &find_data);
if ( handle != INVALID_HANDLE_VALUE ) {
do {
if ( !(find_data.dwFileAttributes & FILE_ATTRIBUTE_DIRECTORY) ) {
filenames.push_back(find_data.cFileName);
}
} while ( FindNextFile(handle, &find_data) );
FindClose(handle);
}

// 列挙されたファイルに対し...
for ( std::vector<std::string>::iterator iter = filenames.begin();
iter != filenames.end(); ++iter ) {
std::string read_filename = *iter;
std::string write_filename = read_filename;
// '.'の手前に12を付加する
write_filename.insert(write_filename.rfind('.'),12);
std::cout << read_filename << -> << write_filename << std::endl;
// read_filename を読み、write_filenameに書く
}

return 0;
}

vectorのpush_backって限界はないんですかねぇ？

どういった限界でしょうか？

>vectorのpush_backって限界はないんですかねぇ？

件数のことであれば size_t がひっくり返るところが限界です。
一般的に２の３２乗か、６４乗か、

ヒープ容量のことでしたら vectorのpush_back とは無関係です。
他の手段でもそれは限界となります。
一般的にファイル名を扱うぐらいであればまったく問題はありません。
普通のPCであればMAX_PATH長のstring数万件でも扱えます。